Pētījumi Āfrikā un Eiropā sniedz atšķirīgus secinājumus
2014. gada decembrī divos pētījumos par HIV salīdzinošo vīrusu izplatību Dienvidāfrikā un Eiropā tika izdarīti divi ļoti atšķirīgi secinājumi.
Pirmais, kas tika veikts Botsvānā un Dienvidāfrikā, ierosināja, ka vīrusa pielāgošana dažām HIV rezistentu gēnu šķirnēm - cilvēka leikocītu antigēns B (HLA-B) - efektīvi mazina vīrusa spēju pavairot, līdz ar to lēnāka slimības progresēšana.
Otrais, kas vairākus gadus sekoja Eiropas pacientu grupai, īpaši apsekoja vidējo vīrusu slodzi un CD4 skaitu tikai pēc akūtas infekcijas stadijas, un secināja, ka tikai slimības progresēšanas ziņā HIV ir kļuvis daudz virulents ar ātrāku slimības progresēšana.
Kā iespējams, ka divi pētījumi beidzās ar tik pārsteidzoši atšķirīgām interpretācijām? Vai tas ir vienkārši apšaubāma pētījuma dizaina gadījums vai ir iespējams, ka vīrusa mainīgums no kontinenta uz kontinentu vai pat no valsts uz otru - ir novedis pie zinātnieku komandām pilnīgi pretējā virzienā?
HIV vīrusu novērtēšana Botsvānā un Dienvidāfrikā
Pirmajā pētījumā Oksfordas Universitātes zinātnieki, kuru vadīja svina pētnieks Rebecca Payne, apšaubīja, vai dažu HLA-B gēnu klātbūtne, kas cieši saistīta ar lēnāku slimības progresēšanu un labāku vīrusu kontroli, varētu izraisīt HIV mutācijas, kas varētu efektīvi vājināt to "vīrusu fitnesa."
Iepriekšējie pētījumi parādīja, ka dažās populācijās bija lielāks indivīdu īpatsvars ar šo reto HIV rezistences mutāciju, sākot no 75% Japānā līdz 20% Dienvidāfrikā. Ņemot vērā neatbilstību, izmeklētāji sāka domāt, vai tas varētu daļēji veicināt plašas atšķirības epidēmijā starp zema izplatības valstīm, piemēram, Japānu, un tādiem pārmērīgiem reģioniem kā Subsahāras Āfrika.
Tā kā Japānā HIV rādītāji joprojām ir relatīvi zemi, pētnieki koncentrējuši savu pētījumu uz pacientu grupu Botsvānā, valstī, kurā HIV epidēmija sasniedza maksimumu 2000. gadā, un salīdzināja to ar Dienvidāfrikas saskaņotu kohortu, kas tikai sasniedza tās maksimums 2010. gadā.
Sākotnējais pētījums atklāja, ka vidējā vīrusu slodze neapstrādātu pacientu vidū Botsvānā, kur slimība ir "vecāka", bija daudz zemāka nekā Dienvidāfrikā, kur slimība ir desmit gadi "jaunāka" (15,350 kopijas / ml, salīdzinot ar 29,350 kopijām / mL, attiecīgi). Turklāt, neraugoties uz to, ka CD4 skaits ir mazāks par 50 šūnām / ml nekā Dienvidāfrikā, Botsvānieši ar HIV ilgstošāk dzīvoja, un tas liecina par mazāk virulentu apakštipu.
Izmantojot šos pierādījumus, pētnieki pētīja pacientu HIV ģenētisko struktūru un konstatēja, ka lielākam Botsvānu skaitam bija HLA-B "evakuācijas" mutācija (tas nozīmē, ka vīruss bija pielāgots HLA molekulas klātbūtnei lai izvairītos no atklāšanas). To darot, zinātnieki uzskatīja, ka vīrusa "fitnesa" potenciāls ir vājinājies, palēninot tā replikācijas spējas, kā arī spēju kaitēt pacienta imūnsistēmai.
Viss teicis, 46% no Botsvānas kohortas bija galvenās HLA-B mutācijas, salīdzinot ar tikai 38% no Dienvidāfrikas iedzīvotājiem.
Pārbaudes mēģenē, šķiet, atbalstīja hipotēzi, kad HIV tika iegūts no Botsvānas parauga, kas atkārtoti reaģēja par 11% lēnāk nekā Dienvidāfrikā.
Balstoties uz statistikas datiem no pirmsdzemdību aprūpes klīnikām, Payne un viņas komanda arī ierosināja, ka Dienvidāfrikā, iespējams, ir samazinājusies arī HIV virulence, un vidējā vīrusu slodze neapstrādātās sievietes samazinās no 13,550 2002.-2005. Gadā līdz 5750 2012. gadā. 2013. gads.
HIV virulences noteikšana Eiropas CASCADE grupā
Eiropas pētījums ieguva daudz vienkāršāku un reālāko pieeju, kurā pacientu dati no ilgstošās Eiropas mēroga CASCADE kohorta tika analizēti no 1979. līdz 2002. gadam.
Savā pētījumā CASCADE pētnieki koncentrējās uz diviem galvenajiem faktoriem:
- vidējais CD4 skaits pēc serokonversijas (kas nosaka, cik dziļi HIV infekcija ir novājinājusi cilvēka imūnsistēmu);
- vidējais vīrusa "noteiktais punkts" (kur vīrusu slodze nokārto pēc akūtas infekcijas stadijas ar lielākām vīrusu slodzēm, kas parasti saistītas ar ātrāku slimības progresēšanu).
Retrospektīvā analīzē pētnieki atklāja, ka vidējais CD4 skaits samazinājās no 770 šūnām / ml 1979. gadā līdz 570 šūnām / ml 2002. gadā, bet vidējais vīrusu daudzums gandrīz trīskāršojās no 11,200 1979. gadā līdz 31 000 2002. gadā.
Vēl jo vairāk tika runāts par ātrumu, kādā slimība, šķiet, turpināja attīstīties gadu no gada cilvēkiem ar HIV. Saskaņā ar pētījumu, vidējais laiks, kāds vajadzīgs pacientiem ar CD4 samazināšanos, ir mazāks par 350, proti, antiretrovīrusu terapiju ieteicams samazināt no septiņiem gadiem 1979. gadā līdz tikai 3,4 gadiem 2002. gadā.
Galvenās atšķirības pētniecībā
Abi pētījumu veidi galu galā ir ierobežoti ar pētījumu plāniem, kas varētu veicināt debates gan zinātnieku, gan politikas veidotāju vidū. Starp galvenajām atšķirībām:
- Kaut arī Āfrikas pētījumā tika pārskatīti statistikas dati no vairāk nekā 2000 pacientiem Botsvānā un Dienvidāfrikā, faktiskais pacientu skaits, kas iekļauts replikācijas jaudas paraugā, bija ne tikai mazs (16 no Dienvidāfrikas un 63 no Botsvānas), bet ņemti vienā brīdī . Savukārt CASCADE grupā tika iekļauti gandrīz 16 000 pacientu, no kuriem visi tika pētīti daudz ilgākā laika periodā.
- Lai gan Payne un viņas komanda koncentrējās uz HLA izraisītu mutāciju ietekmi uz pacienta vīrusu slodzi, viņi nevarēja pierādīt, ka šo mutāciju klātbūtnei bija kāda ietekme uz CD4 noplūdi. Savukārt CASCADE pētnieki uzskatīja, ka CD-4 / vīrusu slodze ir centrāla, lai izveidotu HIV virulenci. Viņi arī ierobežoja iekļaušanu tikai tiem pacientiem, kuri bija diagnosticēti trīs mēnešu laikā pēc inficēšanās, nodrošinot skaidrāku sākuma punktu, lai noteiktu slimības progresēšanu / CD4 noplicināšanos.
- Tomēr ir svarīgi atzīmēt, ka CASCADE komanda veica jutīgu analīžu veikšanu tikai baltajiem un gejiem (lai labāk nodrošinātu ārstēšanas vēstures un vīrusu apakšgrupas vienotību). Kaut gan analīze liecināja, ka vīrusu var izlīdzināties visā Eiropā, tā kā kopējā vīrusu slodze samazinās no 31 000 2002.gadā līdz 25,500 2008.gadā, to pašu nevar teikt par gejiem. Tā kā ir zināms, ka HIV strauja izplatīšanās ar geju vīriešu populāciju (kopā ar augstāku ārstēšanas koncentrāciju) ir radījusi lielāku ģenētisko daudzveidību un izdalīto pretestību , iespējams, ka vīrusu apakšgrupa, kas ietekmē šo grupu, faktiski var būt lielāka virulents
- Savukārt Āfrikas pētījums tika veikts tajās valstīs, kur heteroseksuālais sekss bija ne tikai galvenais transmisijas veids, bet, ja līdz nesenam laikam HIV infekcija bija pakļauta daudz mazākām personām. Rezultātā tiek uzskatīts, ka HIV ģenētiskā daudzveidība Dienvidāfrikā ir daudz mazāka, un daži pētījumi liecina, ka vīrusa reģionālā mainība var radīt dziļas HIV virulences atšķirības.
Īsi sakot, neskatoties uz Āfrikas pētījumu trūkumiem un CASCADE pētījumu ierobežojumiem, abi secinājumi varētu būt labi pareizi. Paredzams, ka abas komandas veiks papildu izmeklēšanu.
Avoti:
Payne, R .; Muenchhoff, M .; Mann, J .; un citi. "HLA izraisītas HIV adaptācijas ietekme uz virulenci populācijās ar augstu HIV seroprevalanci." PNAS. 2014. gada 16. decembris; 111 (50): E5393-5400.
Pantazī, N .; Porter, K .; Costagliola, D .; un citi. "Laikmetīgās tendences HIV-1 virulences un pārnešanas prognostiskajos marķieros: novērošanas kohorta pētījums". L ancet HIV. 2014. gada decembris; 1 (3): e119-126.